用 Sequin 向 NCBI 提交序列 。
(下載頁(yè)面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html)
開(kāi)始一個(gè)新的提交或是選擇編輯已有保存的文件(Read Existing Record),用Sequin的好處就是你可以保存下來(lái),可以隨時(shí)修改。直到滿意后再向NCBI提交。
Title是必須的。自行添寫一個(gè)。然后點(diǎn)Next Page到Contact菜單,添加聯(lián)系方式。再Next Page,填寫作者等。能填寫的就填上,越詳細(xì)當(dāng)然是越好的。不知道的話可以跳過(guò),因?yàn)楹竺嬉彩强梢灾匦滦薷牡摹?/p>
準(zhǔn)備一個(gè)Fasta格式的序列。保存在一個(gè)文件??梢赃x擇單個(gè)序列或是批量序列。其它的Type都是比較特殊,不常見(jiàn)。
上傳了序列之后,點(diǎn)擊Next Page繼續(xù)添加序列的信息,如屬于哪個(gè)物種的,序列注釋。有沒(méi)有蛋白序列等。這里也是一樣,能填的就填上,不懂就Next。后面也是可以修改的。
上面的步驟都完了之后。出現(xiàn)一個(gè)GenBank格式的界面,如下圖。在這里,一切信息就一目了然。那里不對(duì),需要修改的。雙擊就行了。另外,在Edit菜單比較修改作者、聯(lián)系方式等資料。
在Annotate菜單可以添加序列的注釋,也可以批量添加。如加CDS區(qū),exon區(qū)等等。其格式可以參照其它序列的GenBank格式。
如果在中途要臨時(shí)保存,在File菜單的Save,保存后的文件是.sqn。全部修改完畢后,選擇File/Submission。就會(huì)有一個(gè)提示框,提示把保存后的發(fā)送一封郵件到NCBI。
把保存后的.sqn文件發(fā)到[email protected]。等待幾天,NCBI就會(huì)有回音的啦。
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